Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Riau didirikan pada Tahun 1962 dengan Surat Keputusan Menteri Perguruan Tinggi dan Ilmu Pengetahuan No. 123/KPTS/Jur/62 Tanggal 20 September 1962 bersamaan dengan diresmikannya Universitas Riau dengan nama Fakultas Ilmu Pasti dan Ilmu Alam (FIPIA) yang mempunyai tiga jurusan yaitu Matematika, Fisika, dan Kimia. Pada tahun 1983, dengan keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia No. 0537/O/1983, Tanggal 8 Desember 1983, FIPIA berubah namanya menjadi FMIPA dengan Jurusan Matematika, Kimia, dan Fisika.
MATEMATIKA
1962
Program Studi Matematika dengan Sarjana Muda Matematika (B.Sc) di bawah jurusan matematika
1978
Jurusan Matematika membuka Program Sarjana
2012
Jurusan Matematika membuka Program Magister
2016
Jurusan Matematika membuka Program Sarjana Statistika
KIMIA
1962
Jurusan Kimia membuka program
Pendirian Program studi Biologi S1 digagas sejak tahun 1986. Ditindak lanjuti dengan pembuatan proposal berdasarkan SK Rektor No.199/PT22.H/1992. Tahun 1997 menerima mahasiswa baru berdasarkan SK Rektor No.53/PT.22H/Q/1997 melalui seleksi ujian lokal.
Pembukaan Program Studi D3 Manajemen Informatika dimulai sejak tahun 1995 yang telah mendapat persetujuan Rektor Universitas Riau dengan SK. No.094/PT.22.H/Q/1995. Namun dengan berbagai kendala yang dihadapi, pembukaan ini belum dapat diwujudkan. Selanjutnya pada awal tahun 2002 berdasarkan persetujuan dari Senat Universitas Riau, proposal pembukaan Program Studi Diploma Tiga Komputer dan Sistem Informasi diajukan ke Direktorat Jendral Pendidikan Tinggi. Akhirnya surat Pertimbangan izin penyelenggaraan No.719/D2/2002 pada tanggal 16 April 2002 didapatkan secara resmi mendapatkan izin penyelenggaraan pada tanggal 30 Januari 2003 melalui surat Keputusan Direktorat Jendral Pendidikan Tinggi Departemen Pendidikan Nasional Nomor: 180/D/T/2003, yang pada saat itu prodi ini bernama : Program Studi Diploma III Komputer dan Sistem Informasi.
Pada tahun 2006, Program Studi D3 Komputer dan Sistem Informasi berubah nama menjadi Program Studi Manajemen Informatika berdasarkan Surat Keputusan Direktorat Jendral Pendidikan Tinggi Departemen Pendidikan Nasional Nomor 4371/D/T/2006. Program Studi Diploma III Komputer dan Sistem Informasi ini sekaligus rekomendasi dari Pusat Pengembangan Politeknik dan Pendidikan Program Diploma (P5D) Bandung dengan No. 175/P5D/U-DIR/XII/2002